セルA1:A3の内容を天地中央揃えにする。

$sheet->getStyle( 'A1:A3' )->getAlignment()->setVertical( PHPExcel_Style_Alignment::VERTICAL_CENTER );

getAlignmentメソッドのsetVerticalメソッドで縦位置を指定。縦位置は、PHPExcel_Style_AlignmentクラスにてVERTICAL_CENTER（中央揃え）のほか、VERTICAL_TOP（上寄せ）、VERTICAL_BOTTOM（下寄せ）、VERTICAL_JUSTIFY（両端揃え）などが定義されている。